上海交通大学世界一流大学研究中心今日发布2013年“中国两岸四地大学排名”百强榜，清华大学(北京)连续三年位列第一，台湾大学和清华大学(新竹)分别排在第二名和第三名。
上榜的大陆地区达 64所，台湾27所，香港7所，澳门2所。上海9所高校榜上有名，复旦大学和交通大学分列第11名和12名。
相比香港和台湾的大学，大陆高校欠缺有影响力的国际学术大师，“高被引科学家”(注：论文被引频次很高的称为“高被引科学家”)数最多的10所大学中，港台地区的占9所。反映大学师资队伍整体质量的重要指标——“博士学位教师比例”的前九名均为台湾高校，且比例均在90%以上。大陆地区只有北京师范大学一所学校的博士学位教师比例超过80%。
在科学研究方面，大陆高校整体实力雄厚，从“顶尖论文”总数来看，前三名分别是清华大学(北京)、北京大学和香港大学，前十名中大陆大学有8所。但师均“顶尖论文”最多的前三所大学分别是香港大学、阳明大学和香港科技大学，前十名中大陆高校只有4所。
“办学经费”总量前十名中，大陆地区的大学有6所，其中清华大学(北京)办学经费达79亿元人民币，排在第一。北京大学、浙江大学、上海交通大学的总办学经费已经超过香港大学，占据第二至四名的位置。
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