中国校友会网大学评价课题组首席专家、中南大学蔡言厚教授指出，目前，我国两院院士兼职多个工作单位的现象非常普遍，由此引发社会舆论关于限制院士兼职、以便专注于本职工作的议论。为了客观反映出我国两院院士工作成果取得的实际情况，避免围绕两院院士工作单位的不必要误解，以两院院士当选时的申报高校为准。因此，本次调查对中国科学院和中国工程院院士当选院士时的申报高校状况进行统计和分析，以期反映我国高教体制改革后高校的科学研究能力和学术水平的真实情况。
清华新科院士“独占鳌头”，兰州大学“异军突起”
2009年新当选的中国两院院士中，来自高校的院士有39人，其中，清华大学(含中国协和医科大学)新当选的两院院士人数最多，有4人，居全国高校首位，在全国高校中“独占鳌头”；其次是地处西北的兰州大学“异军突起”，新增3名院士；北京大学、哈尔滨工业大学、华中科技大学、四川大学和中山大学各新增2名院士，并列第三；复旦大学、西安交通大学、郑州大学和哈尔滨医科大学等17所高校各新增1名院士。
2009年中国高校新当选两院院士情况
| 名次 | 学校名称 | 院士人数 |
| 1 | 清华大学（含中国协和医科大学） | 4 |
| 2 | 兰州大学 | 3 |
| 3 | 北京大学、中山大学、四川大学、哈尔滨工业大学、华中科技大学 | 2 |
| 4 | 北京工商大学、北京航空航天大学、福州大学、吉林农业大学 | 1 |
| 哈尔滨医科大学、华南农业大学、复旦大学、南方医科大学 | ||
| 南开大学、沈阳农业大学、天津大学、西安交通大学、郑州大学 | ||
| 中国矿业大学、中国地质大学、中国海洋大学、中国科技大学 |