五四运动 之后，梁启超不再过问政事，在家潜心钻研学术，著书立说。他经常把自己关在书房里，通宵达旦地写作，生活没有规律，再加上烟酒过度，身体健康渐渐恶化，最后发展到小便带血。他在写给女儿的信中说： 只要小便时闭着眼睛不看，便什么事都没有了，我觉得殊无理会之必要。 梁启超当时并不知道，小便带血，其实就是尿毒症的症状！
1926年初，随着病情日益加重，梁启超不得不入院治疗。在此之前，有人劝他服用中药，也有人建议他出国治疗，但他坚持选择了北京协和医院，这是当时国内最好的西医医院。梁启超做此选择，还有另一层深意，他毕生笃信西方科学，并极力向国人推广西医，此时正好身体力行，给国人做榜样，当然首选西医。
梁启超对协和医院充满信心，住院时依然乐观豁达，他给家人写信说： 我要你们知道，我快活顽皮的样子，昨晚医生检查身体说，五十岁以上的人体质如此结实，在中国是几乎看不见第二位的。 医生诊断，他的右肾病变，需做切除手术。手术进行得很顺利，但是出院之后，梁启超依然尿血，病情丝毫未见好转，反而有加重的趋势。
回院复查，结果把所有人都惊呆了，手术竟然出现重大失误，医生错把他健康的肾切除了，只留下了一个病变的肾！这是一起重大医疗事故，对于病人而言，后果可想而知，可是事已至此，神仙也无力挽回。
命运往往就是如此诡异，梁启超恐怕做梦也没想到，自己毕生推崇的西医，最终却害了他，悲愤之情不难想象。对于医生极不负责任的行为，梁启超的家人无比愤怒，准备通过法律途径维权。消息传出，当时的各大报刊纷纷撰文谴责协和医院，梁启超是那个时代的精神导师，他的不幸遭遇，牵动着许多中国人的心，尤其是在那个特殊的时代背景下，大多数人本来就对西医心存疑忌。
然而谁也没有料到，就在国人对协和医院口诛笔伐之时，作为受害者的梁启超，竟反过来为医院说话。梁启超发现事态正在扩大，赶紧在某报副刊发表文章《我的病与协和医院》，文中详细讲述了手术经过，并极力为协和医院辩解： 出院之后，直到今日，我还是继续吃协和的药，病虽然没有清楚，但是比未受手术之前，的确好了许多 用意很明显，劝大家不要再追究此事。
大师的宽容，令国人悚然动容。既然当事人都站出来表示既往不咎，别人也就不好再说什么了，在梁启超的努力下，事态渐渐平息。但仍有人感到不解，梁启超遭此变故，自己不追究也就算了，为何还要劝别人不要议论，难道他与医院达成了什么秘密协议？没有人知道真相，此事在当时成了一个谜。
人们只猜中了一半，梁启超心里确实藏着一个不可告人的秘密。当时的旧中国民智未开，大多数普通百姓不懂科学为何物，仍然愚昧守旧，盲目排斥西医。梁启超身为公众人物，一言一行都受到举国关注，此时他如果站出来揭露事故真相，维权当不是什么难事。可是如此一来，对于初入中国的西医，有可能是毁灭性的打击，这也将是民族的灾难。在大义面前，他毅然放弃了个人利益，用心良苦。
1929年1月19日，梁启超因病情恶化在北京逝世，遵照他生前的意愿，墓碑上没有留下关于他生平的任何文字。他像盗火的普罗米修斯，为民族自强自立，不惜燃烧自己。薪尽火传，大师的高风亮节，永远光照后人。